Anthropic akrep zehrine karşı protein bağlayıcıları tasarladı

Anthropic araştırmacıları, Citrini Research iş birliğiyle yürüttükleri çalışmada Claude modelini akrep nörotoksinlerine bağlanan küçük proteinler tasarlamak için kullandı. Her yıl dünyada 1,2 milyondan fazla akrep sokması vakası yaşanırken ve 3 binden fazla insan hayatını kaybederken, pahalı ve geleneksel panzehir yöntemlerine alternatif arayan ekip, yapay zekayı de novo protein tasarımına yönlendirdi. Claude, ilk yönlendirmenin ardından yaklaşık 64 saatlik otonom bir süreçte 318 binden fazla protein adayı üretti.

Araştırma sürecinde Claude, Protein Data Bank ve AlphaFold veri tabanlarını tarayarak Meksika, Brezilya, Kuzey Afrika ve Orta Doğu'daki akrep türlerine ait beş kritik nörotoksin yapısını hedefledi. Üretilen yüz binlerce aday arasından filtrelenen 211 tasarım, Adaptyv Bio ve Twist Bioscience laboratuvarlarında deneysel teste tabi tutuldu. Yüzey plazmon rezonansı yöntemiyle yapılan ölçümlerde, 17 tasarımın hedef nörotoksinlere güçlü bir şekilde bağlandığı belirlendi. Ancak birden fazla toksini aynı anda hedefleyen çoklu bağlayıcı tasarımları eşik kriterlerini karşılayamadı.

Çalışmada elde edilen en güçlü bağlayıcılar olan Cn2-B1 ve Cn2-B2, Meksika akrebi toksini Cn2'ye karşı tek haneli nanomolar düzeyde bağlanma gücü gösterdi. Yapılan yarışma deneyleri, bu tasarımların nörotoksinin sodyum kanallarına bağlandığı bölgeye tutunduğunu ortaya koydu. Anthropic, tasarımların henüz canlı hücrelerde veya hayvanlarda nötralizasyon testinden geçmediğini belirterek tüm 211 tasarımın verilerini bilim dünyasının erişimine açtı.