SQLite'ın yüksek güvenilirliği ve sağlamlığı, titiz ve kapsamlı test süreçleri sayesinde sağlanmaktadır. Kütüphane yaklaşık 155.8 KSLOC C kodundan oluşurken, test kodları ve betikleri 92053.1 KSLOC ile ana kodun tam 590 katına ulaşmaktadır. Bu oran, projenin kaliteye verdiği önemi açıkça göstermektedir. SQLite çekirdek kütüphanesini test etmek için birbirinden bağımsız dört ana test sistemi kullanılmaktadır ve her biri ayrı ayrı tasarlanıp yönetilmektedir.
Bu test sistemlerinden ilki olan TCL Tests, SQLite'ın orijinal testleridir ve geliştirme sürecinde birincil olarak kullanılır. TCL betik diliyle yazılmış bu testler, milyonlarca farklı testin yürütülmesini sağlar. İkinci sistem olan TH3, C dilinde yazılmış özel bir test altyapısıdır ve çekirdek SQLite kütüphanesine %100 dal (branch) ve MC/DC test kapsamı sunar. Özellikle gömülü ve özel platformlar için tasarlanmış olup, tam kapsamlı bir çalıştırmada yaklaşık 2.4 milyon farklı test örneği gerçekleştirir; sürüm öncesi "soak" testlerinde ise 248.5 milyon test yapılır.
Üçüncü sistem olan SQL Logic Test (SLT), SQLite'ı PostgreSQL, MySQL, Microsoft SQL Server ve Oracle 10g gibi diğer SQL veritabanı motorlarıyla karşılaştırarak aynı sonuçları verdiğini doğrular. Bu sistem, 7.2 milyon sorgu ile çalışır. Son olarak, dbsqlfuzz adlı özel bir fuzz test motoru, hem SQL girdilerini hem de veritabanı dosyasını aynı anda değiştirerek yeni hata durumlarına ulaşır. LLVM'in libFuzzer framework'ü kullanılarak geliştirilen dbsqlfuzz, günde yaklaşık bir milyar test mutasyonu gerçekleştirerek SQLite'ın kötü niyetli girdilere karşı sağlamlığını garanti eder.
SQLite'ın olağanüstü güvenilirliği ve sağlamlığı, ana kodundan kat kat fazla olan ve farklı yaklaşımlarla tasarlanmış dört bağımsız test sistemi tarafından sürekli olarak doğrulanmasıyla sağlanmaktadır.